单细胞测序：从Drop-Seq到10xGenomics

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高通量单细胞捕获有两大策略， 一种是微流控芯片技术 ，以10X Genomics、Drop-seq、inDrop为代表 。 另一种，微孔板（microwell）技术，以BD Rhapsody、Seq-Well为代表 。 从诞生年代来看，两者不分伯仲，10X Genomics起源自Drop-Seq技术，得益于哈佛大学研究所的工作。 微流控芯片 技术平台： 1个液滴=1个细胞+1个凝胶微球=1个RNA Seq 微流控芯片技术是将 单个细胞 和 单个凝胶微球 包裹在一个液滴内，细胞裂解释放mRNA，通过逆转录产生用于测序的带条形码的cDNA；液体油层破坏后，cDNA后续进行文库构建，使用测序平台对文库进行测序检测，即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据，10min内自动完成上万个细胞的捕获，从而达到在单细胞水平进行表达测序的目的。 适用范围： 直径40μm 以下细胞 （受仪器管道直径限制）；大规模细胞样本，适用于分群、谱系等研究 ………………………………