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NAR | 西湖大学裴唯珂/张延晓团队研究介绍了scLTdb:一个全面的单细胞谱系追踪数据库

iMedicines  · 公众号  ·  · 2024-10-31 13:10
    

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iMedicines 单细胞谱系追踪(scLT)是一种将细胞条形码与单细胞测序技术相结合的强大技术。这种新方法能够以单细胞分辨率同时测量细胞命运和分子谱,揭示细胞命运决定的基因调控程序。然而,目前还没有一个全面的scLT数据库。 2024年10月29日, 西湖大学 裴唯珂,张延晓共同通讯 在 Nucleic Acids Research   在线发表题为 “ scLTdb: a comprehensive single-cell lineage tracing database ” 的研究论文, 该研究 介绍单细胞谱系追踪数据库(scLTdb,https://scltdb.com)包含109个数据集,这些数据集是通过标准管道手动策划和分析的。 scLTdb提供交互式分析模块,用于可视化和重新分析scLT数据集,特别是综合细胞命运分析和谱系关系分析。重要的是,scLTdb还允许用户识别与命运相关的基因特征。总之, scLTdb为scLT数据探索和分析提供了一个交互式界面,将有助于理解细胞命运决 ………………………………

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