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Sci. Adv. | 陈迪俊课题组开发基于单细胞和空间转录组的肿瘤微环境空间域识别方法

DrugAI  · 公众号  ·  · 2024-10-08 00:01

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细胞是生命的基本单位,其在组织内的空间分布和组成决定了系统的结构和功能。例如,在神经组织中,神经元和胶质细胞以特定的方式排列,确保信息的高效传递;在肝脏中,不同类型细胞(如肝细胞和库普弗细胞)在解剖学上形成特定的结构,发挥代谢和免疫的双重功能。在肿瘤微环境中,肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞的相互作用和空间重塑可以影响肿瘤的生长、侵袭和转移。然而,肿瘤微环境是一个极其复杂的异质性系统,不同的细胞群体在肿瘤的不同阶段和微环境条件下表现出多样化的空间分布与组成,这种异质性极大地限制了对其功能的全面解析。因此,识别具备特定细胞分布和组成的空间区域,即所谓的“空间域”(spatial domain),对于揭示肿瘤微环境的功能至关重要。这些空间域可能成为关键的细胞信号传递与相互作用的“热点 ………………………………

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