AlphaFold Database的在线搜索和使用

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本文约4000字，目录： 一、AFDB网站内容 二、AFDB在线搜索 三、AFDB预测结果的官方推荐的批量下载 四、AFDB预测结构的非官方的批量下载 五、AFDB的局限 末、使用须知 AlphaFold Database（以下简称AFDB）是DeepMind联合欧洲分子生物学实验室的欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）共同发布的蛋白质预测结构的数据库网站。经过几轮更新扩容和错误修正，目前AFDB含有约2.14亿个使用AlphaFold2预测的单体蛋白质的结构，可供用户免费检索、查看、下载。 这里，我们只介绍如何使用AFDB。 一、AFDB网站内容 AFDB的网址为： https://alphafold.ebi.ac.uk/ ，中国大陆用户可以无障碍访问，其首页截图如下。 AFDB网站首页截图，截图时间2024.9。 目前，AFDB含有UniProt 2021_04的绝大部分序列的预测结构，共214,683,839个，包括48个完整的生物蛋白质组。这其中大部分的预测结果来自AF2的单一推 ………………………………