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重要降维分析方法PCA、Bray-Curtis PCoA和 Bray-Curtis NMDS分析你会了吗?视频教程看一下!

AI4ST  · 公众号  ·  · 2024-12-01 08:00
    

主要观点总结

本文介绍了微科盟生科云平台的功能和特点,包括一键式批量宏基因组数据分析流程、单个分析小程序、PCA、Bray-Curtis PCoA和Bray-Curtis NMDS等重要降维分析方法,以及分析方法的具体操作步骤和教程。文章还提供了如何导入丰度表和分组信息表,如何选择分组方案和颜色等操作的详细说明。此外,文章还介绍了该平台持续升级中,多个组学将陆续投入使用,并提供了相关阅读推荐。

关键观点总结

关键观点1: 微科盟生科云平台的功能和特点

该平台旨在帮助客户简化分析流程,助力科研。不仅开发了自动化的一键式批量宏基因组数据分析流程,还提供了单个分析小程序,可灵活分析。

关键观点2: PCA、Bray-Curtis PCoA和Bray-Curtis NMDS分析的重要性

PCA等降维分析方法适用于生态学研究的重降维分析,能够提取数据中的主要元素和结构,揭示复杂数据背后的简单规律。

关键观点3: 分析流程和操作方法的详细说明

文章提供了详细的操作步骤和教程,包括导入丰度表和分组信息表、选定分组方案和颜色、提交任务等。

关键观点4: 平台的持续升级和多个组学的使用

平台持续升级中,多个组学将陆续投入使用,用户需关注平台以获取最新信息。


文章预览

点击蓝字“代谢组metabolome”,轻松关注不迷路 生科云网址: https://www.bioincloud.tech/ 微科盟生科云 (https://www.bioincloud.tech)  旨在帮助客户 简化 分析流程, 助力 科研的基础上,不仅开发了 全自动化 的 一键式 批量 宏基因组 数据分析流程,还开发了 单个 分析 小程序 ,可大大方便客户 灵活 分析。   PCA 、 Bray-Curtis   PCoA 和 Bray-Curtis   NMDS分析 是一类适用于 生态学 研究的 重要降维分析 方法。其中, PCA (基于欧式距离的 PCoA )是基于 线型模型 的一种降维分析,它应用 方差分解 的方法对 多维数据 进行 降维 ,从而提取出数据中 最主要的元素 和 结构 , PCA  能够提取出 最大程度反映样品间差异 的两个 坐标轴 ,从而将多维数据的 差异 反映在 二维坐标图 上,进而揭示 复杂数据 背景下的 简单规律 。     Bray-Curtis  NMDS 是 非线性模型 ,更好地反 ………………………………

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