Cell | AI驱动的分子对接与精准质谱技术的结合揭示大肠杆菌中蛋白质-代谢物相互作用网络

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撰文 | Qi 蛋白质与代谢物之间的相互作用 （Protein-Metabolite Interactions, PMIs ） 是理解细胞代谢、信号传导和基因调控的关键。尽管蛋白质-蛋白质相互作用 （PPIs） 的研究已经取得了显著进展，但蛋白质与代谢物之间的相互作用仍然是一个相对未被充分探索的领域。代谢物是细胞内的重要组成部分，参与了几乎所有的生化反应，包括代谢途径的调控和转录因子的激活。然而，由于技术上的挑战，尤其是在活细胞内监测小分子与蛋白质的结合，PMIs的研究进展相对缓慢。 大肠杆菌作为一种模式生物，其代谢和调控网络已经被广泛研究，并且有大量的公共数据库 （如KEGG和EcoCyc） 记录了其代谢途径和基因调控网络。然而，尽管这些数据库提供了丰富的预测信息，但只有一小部分预测的PMIs得到了实验验证。许多代谢反应中的底物和产物是已知的，但对应的 ………………………………