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Nat Meth| G2G-基因水平【比较】两个单细胞轨迹?

生信益站  · 公众号  ·  · 2024-09-23 08:00

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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ ❝ 简单理解就是 两个(或更多)轨迹之间的比较 ,例如 对照组与药物治疗组 ,或 体外细胞分化与体内细胞发育 ,其中 识别差异调控的基因可以指导我们改进体外细胞分化 。 引言 单细胞技术,尤其是单细胞 RNA 测序(scRNA-seq),彻底改变了我们对生物学的理解,开辟了新的研究途径。它们能够同时观察每个细胞中的数千个基因,从而描述细胞的过渡状态和动态细胞过程(例如分化/发育;对扰动的反应)。为动态过程推导“时间线”(例如基于转录组相似性)的计算任务称为“ 伪时间轨迹推断” 。 ❝ 一个关键挑战是如何比较两个(或更多)轨迹 ,例如对照组与药物治疗组,或体外细胞分化与体内细胞发育,其中识别差异调控的基因可以 ………………………………

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