正确且快速找同源基因，Find Best Homology 功能优化

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写在前面 两三年前，我发现很多人直接用 BLAST 就去找同源基因。事实上，这个并不是一个正确的做法。前段时间，我写了两三个推送，大体就是讲明白这个事情。当然事情虽然讲明白了，TBtools 对应的功能 Find Best Homology 我还没来得及更新。 需要更新什么？详细看看下图 这个是前面版本的 Find Best Homology 的效果。可以看到，虽然黄色是目标ID，红色是感兴趣物种中的同源基因，但这个树看起来，其实并不是那么一回事。事实上，这个就是前些日子说的，很多人没有真正理解进化树，无根树和有根树等等。显而易见，如果按照有根树处理，那么上述这个结果是不可能正确的。上述的操作，我采用所有节点逐个置根，定出最优分支。（事实上，这是一个野蛮和并不那么靠谱的做法，大体可以理解为，既然我不知道哪里是根，我就约等于无根来做） 更新 ………………………………