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导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Identification of novel immune-related signatures for keloid diagnosis and treatment insights from integrated bulk RNA-seq and scRNA-seq analysis”,这篇文章发表在 Hum Genomics 期刊上,影响因子为3.8。 结果: 鉴定瘢痕疙瘩中差异表达的免疫相关基因 作者基于瘢痕疙瘩批量 RNA-seq 进行了一系列分析,系统研究了瘢痕疙瘩中免疫相关基因的功能,本研究的工作流程图如图 1 所示。 然而,不同的数据集表现出数据异质性和批量效应。无花果。 阿拉伯数字 A 和 B 说明了合并前 GSE44270 和 GSE7890 的总体概况。作者使用了 R 包 “sva” 中的 “ComBat” 函数来消除批处理效应 ,以及使用 ComBat 函数移除批处理效果后的 GSE44270 数据。结果表明,样品分布均匀,去除了 GSE7890 和 GSE44270 之间的批次效应,数据可用于后续分析。 在此之后,作者通过基
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