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空间转录组+单细胞转录组:3例样本发10+SCI论文

转化与基础研究  · 公众号  ·  · 2023-06-05 12:01
    

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单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 可以提供详实的每个细胞的转录表达信息,但是缺失了来源组织的空间组成信息。空间转录组 (ST) 技术可以提供完整的组织空间位置信息,但是无法达到单细胞分辨率。单细胞测序联合空间转录组测序可以获得单个细胞的空间转录表达信息,是当前的研究热点。 肿瘤微环境 (TME) 是影响肿瘤发生和转移的重要因素,也是研究肿瘤免疫和侵袭等热点问题的关注方向。国家癌症中心研究者通过对三名食管鳞状细胞癌 (ESCC) 患者来源的组织样本进行scRNA-seq和空间转录组测序,揭示TME中不同细胞亚群的空间格局,以及不同细胞之间潜在的串扰,还发现了非转移性和转移性样本之间的转录组差异和独特的地理模式,为ESCC的不同肿瘤生态系统提供了以前未知的见解,并对癌症干预有潜在的好处。 文章信息 Integrating microarray-based ………………………………

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