TO-GCN实战篇 (2)：适用于3维数据

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生信益站，一点就有益 ！ 祝友友们天天开心，月月发 CNS~ 设我为🌟星标，每天就能第一时间看到推送啦~ TO-GCN，时序基因共表达网络分析 实战篇（2）—— 适合3D的数据（比如2个品种/条件 X 5个时间点 X N个基因） ❝ 注意： TO-GCN至少需要5个时间点。 具体分析步骤如下： 1、整理表达矩阵 ❝ 下载自文章(文末有文章链接)的附件， 文章附件只提供了差异表达基因的矩阵 （没有提供全部基因的表达矩阵，原文章用的所有基因进行的分析 ）。 表达矩阵需要2套。 一套是所有样品（ 包含生物学重复），这里是2个品种，7个时间点（3个重复），所以一共是42个样品(前21列是一个品种，后21列是另一个品种)： $ csvtk  stat  -t matrix.all.tsv file             num_cols   num_rows matrix.all.tsv         43      6,525 $ csvtk  stat  -t matrix.tf.tsv file          ………………………………