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北京大学林文翰/范爱丽组JACS|基因组挖掘与生物合成研究助力真菌DMOA来源杂萜分子的高效定向发现

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-11-20 21:00
    

主要观点总结

本文利用生物合成指导和后修饰酶催化的策略,成功发现了23种新的Dhilirane型杂萜(DMs),包括7个新骨架结构。研究了DhiD和DhiH两种关键酶在DMs生物合成中的作用,并揭示了它们的功能多样性和催化机制。实验结果表明部分DMs具有杀虫和抗炎活性。该研究推动了DMs的化学扩展和靶向发现,显示出生物合成指导和酶催化定制策略在天然产物发现领域的巨大潜力。

关键观点总结

关键观点1: 成功发现23种新的Dhilirane型杂萜(DMs),包括7个新骨架结构。

通过基因组挖掘、代谢产物分析和后修饰酶催化等工作流程,鉴定了新DMs。其中DhiD和DhiH两种酶在DMs的生物合成中扮演关键角色。

关键观点2: 揭示了DhiD和DhiH的功能多样性和催化机制。

DhiD具有多功能性,可以催化多种反应以丰富结构多样性。DhiH则通过构建C-C键和氧化反应,重塑了DMs的结构多样性。晶体学和突变实验为两者的反应和立体异构产物的形成提供了分子基础。

关键观点3: 部分DMs表现出良好的杀虫和抗炎活性。

生物活性实验结果表明DMs具有潜在的生物活性,为药物研发提供了新的候选化合物。

关键观点4: 研究凸显了生物合成指导和酶催化定制策略的重要性。

随着真菌基因组资源的日益丰富,该方法将推动更广泛化学空间的探索,为发现目标天然产物提供强有力的支持。


文章预览

01 遇见/摘要 Dhilirane 型杂萜分子( DMs )以其独特的 6/6/6/5/5 环系结构,成为真菌萜类化合物中一个罕见的类别。迄今为止,仅鉴定出 11 个同系物,其化学多样性在很大程度上仍未被探索。本文基于对其生物合成的理解,开发了一种通过基因组挖掘、代谢产物分析和后修饰酶催化来发现 DMs 的工作流程。据此鉴定了 23 种新的 DMs ,其中包括 7 种新骨架结构。研究发现, Fe(II)/α- 酮戊二酸( α-KG )依赖型加氧酶 DhiD 能够催化 dhilirolide D 的非立体选择性环收缩,形成 dhilirane 骨架;而细胞色素 P450 酶 DhiH 则通过构建多种 C-C 键和氧化反应,重塑了 DMs 的结构多样性。晶体学和突变实验为 DhiD 的反应及其立体异构产物的形成提供了分子基础。并且, DhiD 在 DMs 化学扩展中表现出底物控制的催化多功能性,通过缩环、羟化、脱氢、环氧化、异构化、差向异构化 ………………………………

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