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基于活性的蛋白质分析新方法,登上Nature Chemistry!

BioMed科技  · 公众号  ·  · 2024-08-16 19:51
    

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癌细胞中色氨酸丙烯酰胺-蛋白质相互作用的多层化学蛋白质组学图谱 共价化学是一种扩展人类蛋白质组可连接性的多功能方法。 基于活性蛋白质谱 (ABPP)可以通过与广泛反应的探针竞争来推断亲电化合物修饰的特定残基。然而,这种残基导向平台在多大程度上评估了细胞中亲电化合物的蛋白质靶标尚不清楚。 在此, 斯克里普斯研究所 Benjamin F. Cravatt 、 Bruno Melillo 和 Evert Njomen 等人 提出了一种互补的蛋白质导向ABPP方法,该方法可鉴定与炔基化手性亲电化合物(称为立体探针)具有立体选择性反应的蛋白质。整合来自用胰蛋白酶-丙烯酰胺立体探针处理的癌症细胞的蛋白质和半胱氨酸导向数据,揭示了总体上相关性良好的连接性图谱和突出的特征,如蛋白质大小和含半胱氨酸肽的蛋白型,这些特征解释了每个ABPP平台中的缺口。总的来说,作者确定 ………………………………

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