专栏名称: 植物科学最前沿
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华中农大章元明教授团队在大型生物样本关联分析高效快速算法研究中取得重要进展

植物科学最前沿  · 公众号  ·  · 2024-06-20 17:57

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近日,Briefings in Bioinformatics在线发表了华中农业大学植物科学技术学院章元明团队的题为“FastBiCmrMLM: a fast and powerful compressed variance component mixed logistic model for big genomic case-control genome-wide association study”的研究论文。该研究提出了一种多位点混合逻辑回归全模型的大型生物样本关联分析高效快速FastBiCmrMLM算法与软件,专门检测抗感二分类性状或case-control数据的性状与标记关联,是目前运行速度很快、检测功效最高和假阳性控制严格的二分类性状关联分析新工具。             GWAS是一种广泛应用于动植物、微生物和人类遗传学的基因挖掘方法。以混合线性模型为基础的GWAS方法是在控制群体结构和遗传背景情况下高功效检测性状与标记间的关联,在过去20年得到广泛应用和发展。然而,目前的方法存在以下问题。第一,随着英国生物样本库(UK Biobank ………………………………

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