关于测序接头的那些事儿

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接头的本质是一段短的碱基序列，作为桥梁连接待测DNA片段与 Flow-cell。以Illumina测序平台为例，包括三个部分： 与Flow-cell上寡核苷酸链相同或互补的片段P5/P 7； 测序引物结合部分Read1/2 ； 用于区分不同样本的 Index 。Index 是混样中不同样本的「身份证」，一般长6nt或8nt（现在一般 8-10nt），四种碱基的不同排列组合可以形成不同的Index标识。 接头分类方法主要有两种，根据 Index 位置可以将接头分为 单端Index接头 和 双端Index接头 。单端Index接头指的是仅在一端存在Index（一般在P7端），双端Index接头指的在P5和P7端均存在Index。测序仪的产量在不断增加，双端Index比单端Index能容纳更多数目的样本，所以双端Index的接头被广泛使用。 早期阶段测序接头结构主要以Illumina的 Y字型 为主（下图），随后国产MGI 测序平台崛起，市面上也不再是Y字型接头为主。从 ………………………………