专栏名称: 生信分析手册
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生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-07-16 18:00

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Identification and validation of biomarkers related to Th1 cell infiltration in neuropathic pain”,这篇文章发表在J Inflamm (Lond)期刊上,影响因子为5.1。 研究流程 分析步骤的流程图如图1所示。所有数据均从GEO数据库下载,并在表中进行排序表1.1.首先,作者合并了GSE102721和GSE149770数据集,获得了9个Con和10个SNI样本。然后,消除了数据之间的批量效应。数据集归一化后,聚类分布是均匀的,表明数据的可靠性(图2A和B)。 DEG的筛选和富集分析 从合并的基因表达矩阵中,在Con和SNI组之间共鉴定出163个DEG(114个上调和49个下调),如火山图和热图所示(图2C和D)。图2E和F显示了GO和KEGG的功能相关性分析结果。GO分析结果表明,DEG参与三种细胞功能:生物过程(BP)、细胞成分(CC)和分子功能(MF)(图2E)。血压的主要变化是氨基酸 ………………………………

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