你一直做错！用BLAST找同源基因查看功能？

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海南台风了，办公室电脑只能提前关机。于是我也干不了活了。翻翻一些文献，看到一张图，我觉得很不错。 于是想着，拿来分享最好。我知道，绝大多数人，我的意思是几乎所有人，除非一线且经验非常丰富的人，甚至除非是有开发相关功能工具的人，比如我在 TBtools 里面写的 Find Best Homology，之外，大概率都不会知道，如果你就是基于 BLAST 来查找感兴趣的物种的同源基因？或者是通过最优比对来试图推测基因的功能，是一件多么危险的事情。 下面这张图可以很好说明问题。 其中「query」就是我们的查询序列，而「closest」就是最接近或者你可以认为是相似的序列。显而易见： A：最优比对可以推断query功能或者分支（实际上，TBtools Find Best Homology 就是这个判断方法，目前似乎还没有人复制 TBtools 这个操作，不过咱们也习惯被复制了）； B：从树 ………………………………