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​谁敢横刀立马,唯我公开数据集!内质网应激+单细胞+机器学习,干湿结合完美思路,发文如德芙般纵享丝滑!

生信图书馆  · 公众号  ·  · 2024-08-04 19:00

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馆长听到了小伙伴们的呼唤快快的出现在你滴眼前!最近闲来无事想给小伙伴们找点新鲜玩意分享一下嘞,逛着逛着发现了一篇刚刚发表于Journal of Translational Medicine没几日的文章,相比于该期刊其它文献接受过程较缓慢,因此肯定本文在各方面应该是比较完美的状态啦!馆长细细看了一下,干湿结合,思路完整,迫不及待地要跟大家分享,且看馆长带你慢慢学习! 本文整合 GEO数据集 (GSE25097、GSE62232、GSE65372)来识别与HCC相关的差异表达基因(ERSRG),应用 随机森林(RF)和支持向量机(SVM) 机器学习技术筛选与 内质网应激 相关的ERSRG,并构建人工神经网络( ANN) 诊断预测模型。还使用 ESTIMATE算法 分析ERSRG与免疫微环境之间的相关性,利用 药物特征数据库(DSigDB) 对ERSRG的潜在治疗药物进行研究。通过 单细胞测序 评估了ERSRGs中心基因PPP1R16A的 ………………………………

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