专栏名称: 生信分析手册
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衰老+机器学习与单细胞相关!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-11-25 18:09

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ARDS and aging: TYMS emerges as a promising biomarker and therapeutic target”,这篇文章发表在 Front Immunol 期刊上,影响因子为5.7。 结果: 确定 ARGEG 研究程序图见 图 1。在对照组和 ARDS 气管吸出物之间共鉴定出 2448 个 DEGs,其中 1312 个基因上调,1136 个基因下调( 图 2A) 。通过ARGs和DEGs的交叉得到了134个ARDEGs( 图2B;补充表S1) 。使用 R 程序 limma,从训练集中提取 ARGs 的表达矩阵,并检查它们之间的差异。绘制的基因表达热图显示了差异最显著的前 50 个基因( 图 2C) 。通过 PPI 蛋白网络分析发现,ARDEGs 之间在蛋白质水平上存在密切联系( 图 2D;补充表 S2) 。 ARDEG 的功能富集分析 为了了解ARDEGs在ARDS和衰老中的潜在机制,作者使用R软件包clusterProfiler对ARDEGs进行了GO和KEGG富集研究( 补充表S3, 4) 。BP的GO富集分析表明, ………………………………

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