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大约1个月前(2024.8.26),Nature上线了一篇由2020年诺贝尔化学奖得 詹妮弗·安妮·杜德娜 (Jennifer A. Doudna)的课题组发表的论文。杜德娜是加州大学伯克利分校分子与细胞生物学系和化学系的双聘教授,因为基因编辑而与 埃玛纽埃尔·卡彭蒂耶 分享诺奖。 杜德娜课题组用AlphaFold2预测出真核病毒组的蛋白质结构,有效填补了AlphaFold Database在这方面的空白,凭借微小体量的预测结构数据集登顶Nature,是蛋白质结构生物信息学领域一篇新的重要工作。 Nature 633, 710–717 (2024) 我很快就比较仔细地阅读了这篇论文,发现有笔误。 在论文第三页的最下方,作者提到,她们将自己预测的病毒蛋白的结构和 AlphaFold Database内21种生物的蛋白组结构进行了比对 —— 后者是AlphaFold Database首次发布时所包含的结构,大约30万个。比对的结果对应于论文的图3a。 然而,在
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