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Adv Sci丨裴昊/朱通团队合作提出基于量子化学的深度学习模型用于预测DNA反应

BioArtMED  · 公众号  ·  · 2024-09-30 14:30
    

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DNA分子反应 (如分子杂交、链交换和链置换等) 在合成生物学、基因编辑、分子诊断以及DNA计算和存储等领域具有重要应用价值,其用于设计可编程生物系统、实现精准治疗和疾病检测的潜力巨大。为了提升实验效率、优化反应条件,并减少实验中的不确定性,发展计算工具来预测DNA反应参数至关重要。传统的预测方法 (如Mfold和Nupack) 依赖最近邻模型,通过线性求和计算DNA杂交反应的自由能,但精度限制了它们在高精度实验中的应用。人工智能 (AI) 技术有潜力突破这一瓶颈,通过算法创新更好地捕捉反应中的非线性特性。然而,现有的AI模型虽然能够预测部分动力学参数,却依赖大量数据,并且应用范围有限。因此,如何建立高精度、强泛化性的DNA分子反应预测模型仍然是一个亟待解决的问题。 近日,华东师范大学 裴昊 和 朱通 教授团队 ………………………………

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