monocle2拟时序分析 笔记

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写在开头 叮！笔记整理第二弹——monocle2拟时序分析，还是一样的，前辈们已经整理了太多有用的资料，我就浅浅汇总摘抄一下叭！ 本来前段时间整理学徒笔记的时候，就整理了一篇非常详细的拟时序分析相关的推文—— 单细胞测序—拟时序分析综合 ，仔细读完之后发现是拟时序分析高级版hhh 所以又搜罗了一批推文，进行了阅读整理与汇总，本着独乐乐不如众乐乐的原则分享给大家！ 背景知识 单细胞组学 | 第28期. 拟时序分析，看这里！ 拟时序分析（Pseudotime Analysis），又称细胞轨迹分析（Cell Trajectory Analysis），是一种在单细胞转录组学中常用的方法，通过对细胞在特定生物过程中的转录组数据进行排序，推断其发展或变化的时间顺序。 尽管单细胞数据通常是静态的（在一个时间点采集）， 拟时序分析通过基因表达的变化模式来重建细胞的发 ………………………………