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Cell Res|西湖大学卢培龙团队:精确从头设计镜像结合蛋白

智药邦  · 公众号  ·  · 2024-09-03 09:00

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D型蛋白质是其多肽链由D-氨基酸和非手性氨基酸甘氨酸组成的蛋白质分子,D型蛋白质可以与天然的L型蛋白质靶点形成特异性的异手性蛋白-蛋白相互作用,由于其高度的生物正交性和稳定性,在分子工具、治疗和诊断方面具有显著的潜力。为了鉴定能够与L型蛋白质靶向结合的D型蛋白质,研究人员建立了镜像肽噬菌体展示技术。然而,精确靶向目标蛋白的特定表面区域并在初始随机文库中确认有效结合物的存在仍然具有挑战性。 与传统的选择方法相比,计算方法提供了一种更先进的策略,通过靶向目标蛋白表面的特定区域来识别结合物。L型蛋白质被设计用于结合天然存在的靶蛋白。然而,在设计靶向L型蛋白质的D型蛋白质时,由于我们对L型蛋白质和设计靶向L型蛋白质的D型蛋白质之间的异手性相互作用了解有限,因此在蛋白质数据库(PDB)中,只 ………………………………

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