iMeta高被引论文 | 最全可视化韦恩图和集合图工具EVenn使用手册

主要观点总结

文章介绍了全面的韦恩功能、高效的数据探索、用户友好的界面，使EVenn成为研究人员解读多组学数据的好用工具。文章概述了EVenn的各种应用，包括韦恩图的代表性结果解读、数据中心管理数据，多个案例演示。同时，展示了交互式韦恩图、欧拉图、UpSet图、花瓣图、交互式花瓣图、韦恩网络等可视化技术的使用，并介绍了数据中心的数据输入和参数限制。案例部分详细展示了韦恩图、欧拉图、UpSet图、花瓣图、韦恩网络在不同数据集上的应用，并提供了代码和数据可用性。

关键观点总结

关键观点1: 全面的韦恩功能

EVenn提供了统一的平台，包含多种韦恩图工具，满足了代谢组学、基因组学、转录组学和蛋白质组学等多组学数据分析的复杂需求。

关键观点2: 高效的数据探索

EVenn的数据中心支持标准化的数据格式，简化数据上传和分析过程。文章通过案例展示了其实用性。

关键观点3: 用户友好的界面

EVenn拥有易用的界面，简化了各种韦恩图、欧拉图、UpSet图、花瓣图、交互式花瓣图、韦恩网络的生成过程。

关键观点4: 数据中心的数据输入和参数限制

EVenn的数据中心使用标准化的两列矩阵格式来简化输入过程，同时引入了数据智能参数限制，提升了用户体验。

关键观点5: 案例展示

文章通过五个案例展示了EVenn的实用性，包括交互式韦恩图展示差异代谢物、欧拉图展示差异表达基因关系、UpSet图展示ChIP-seq数据、交互式花瓣图展示微生物群落的特异性、韦恩网络显示GO富集结果。

文章预览

点击蓝字 关注我们 最全可视化集合工具EVenn使用手册 iMeta主页：http://www.imeta.science 研究论文 ●  期刊： iMeta （IF 23.8） ●  原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.184 ●  2024年4月11日，中国中医科学院陈同、黄璐琦和中国农科院深圳基因组所刘永鑫等团队在 iMeta 在线联合发表了题为 “ Visualizing set relationships: EVenn's comprehensive approach to Venn diagrams ” 的文章。 ●  本文概述了EVenn的各种应用，包括韦恩图的代表性结果解读、数据中心管理数据，多个案例演示。通过这些功能，使EVenn成为一个用户友好的集合关系探索工具，为深入探索多组学数据提供强大的支持。 ●  第一作者： 杨莓 ●  通讯作者： 陈同（ chent@nrc.ac.cn ） 、刘永鑫（ liuyongxin@caas.cn ） 、黄璐琦（ huangluqi01@126.com ） ●  主要单位：天津中医药大学中医药研究院、中国中医科学院中药资源 ………………………………