一个数据里两种分组信息怎么做差异分析

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 今天是生信星球陪你的 第974天     公众号里的文章大多数需要编程基础，如果因为代码看不懂，而跟不上正文的节奏，可以来找我学习，相当于给自己一个新手保护期。 我的课程都是循环开课。 下一期的时间，点进去咨询微信↓ 生信分析直播课程 生信新手保护学习 ‍ 小组 单细胞陪伴学习小组 1.背景知识 众所周知，limma可以做基因表达芯片和转录组数据的差异分析，可以方便的得处两组之间有表达量差别的基因。多分组差异分析其实也是两两差异分析的批量做法。 有的实验设计相对复杂一点，比如今天使用的例子： 实验设计包括了两种分组，一个是siC和sip53，一个是NT与TNF。 那么常规的两组之间的差异分析也就不能同时分析这两种实验设计啦！ 这时候我们就需要用到双因素差异分析。 1.整理表达矩阵 rm ( list = ls ()) library (tinyarray) library (tid ………………………………