2024年Nature Communications计算生物学亮点论文评述（2）——单细胞多组学整合与深度分析

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【编者按】：在第一篇总述（ 年度总结 | 2024年Nature Communications计算生物学方法论文精选 ）中，我们回顾了《自然通讯》杂志计算生物学方法亮点论文，展望了未来的领域发展。从本篇开始，将对各细分领域的亮点论文进行评述，首先会总述此领域的当前研究进展，随后会挑选若干篇例文进行内容介绍与评论，最后展望此领域的发展方向。 （一） 总述 2024年，单细胞组学算法依然在计算生物学领域占有重要篇幅。经典的下游任务算法涵盖了 细胞聚类、差异基因分析、细胞类型注释、多批次多模态数据整合、细胞通讯预测以及基因调控网络预测 等通用算法。此外，针对特定生物学问题的分析任务也出现新的算法，例如 疾病特异性可变剪切分析、跨模态单细胞数据模拟器、罕见细胞发现算法、细胞分化路径与RNA速率预测、扰动预测以及metacell巨型细 ………………………………