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纯生信也能发到4+,免疫治疗反应相关+预后模型+免疫浸润,这样的套路一学就会!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-08-10 15:10

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Bioinformatics analysis of an immunotherapy responsiveness-related gene signature in predicting lung adenocarcinoma prognosis”,这篇文章发表在 Transl Lung Cancer Res 期刊上,影响因子为4。 结果: 免疫治疗反应性相关DEGs的筛选和功能分析 首先,作者旨在确定免疫治疗反应者和免疫治疗无反应者之间的DEGs。共获得1,635个DEGs,其中1,161个上调(log2FC>1 和 P < 0.05) 与无反应者相比,其中 475 例下调(log2FC>1, P < 0.05) (图2A,2B).在利用GO富集分析探索DEGs的功能时,作者首先发现免疫治疗反应性相关性DEGs与中性粒细胞活化(图2C).在KEGG富集分析中,作者发现免疫治疗反应性相关的DEGs与细胞粘附分子(图2D). 建立包含免疫治疗反应性相关 DEG 的风险评分公式 绘制了一张维恩图,显示了 1,514 个共表达的免疫治疗反应性相关 DEGGSE126044、TCGA-LUAD 和GSE ………………………………

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