实验二十 | 微卫星(SSR)标记分析 (知识分享）

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作者 | NIRO 来源 | NIRO（ID：NIRO-keyanmiao） 编辑 | 澹泊研究僧 微卫星(microsatellite)又称简单序列重复(simple sequence repeat，SSR)，是一类由几个碱基(如1~4 bp)为重复单位组成的长达几十bp的串联重复序列，这些串联重复序列由于重复次数的不同而造成序列长度的多态性。 图片来源: 网络 微卫星标记是一种以PCR技术为基础的分子标记具有操作简便、成本低等优点。SSR标记主要通过两种方法获得，一种是通过生物信息学手段搜索数据库中的核酸序列获得，另一种是通过分子杂交技术筛选基因组文库获得。在找到一段重复序列后，可根据重复序列两侧保守的基因组序列设计引物并进行PCR扩增，通过多态性分析和定位，确认是否为新的微卫星标记。 虽然开发新的SSR标记比较困难，然而一旦开发成功，它就能广泛用于基因定位、QTL分析、种间杂交分析、品种鉴定和 ………………………………