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松散序列空间的蛋白设计 Scalable protein design using optimization in a relaxed sequence space 这篇文章是由 Sergey Ovchinnikov 等人撰写的,题为“Scalable protein design using optimization in a relaxed sequence space”,发表在《Science》杂志上,日期为2024年10月25日。 文章主要介绍了一种改进版的幻觉(Hallucination)蛋白设计方法,ROS 。该方法能够在一个放松的序列空间中进行高效的 蛋白骨架设计 。这种方法不需要重新训练,可以应用于多种规模的设计任务, 包括单体蛋白、Binder 骨架生成等 。 关键词 蛋白设计|骨架生成|Binder设计|单体设计 代码 https://github.com/sokrypton/ColabDesign/blob/main/af/examples/RSO.ipynb 速览 RSO是一种改进版的Hallucination RSO可应用三种蛋白设计任务 蛋白单体设计 Binder设计 功能位点支架(Site Scaffolding) RSO在大型蛋白单体设计任务上,突破1000个氨基酸的瓶颈 RSO
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