主要观点总结
文章介绍了南方科技大学医学院冯宇亮课题组联合多家研究机构开发的多组学数据库EXPRESSO，该数据库整合了人类不同组织的三维基因组学数据，为研究基因组三维结构与转录调控之间的关系提供了全面的资源。数据库具有多种特色功能，包括可视化、用户友好的界面、REST API接口等。
关键观点总结
关键观点1: 染色质构象捕获技术及多组学数据库的重要性
随着染色质构象捕获技术的发展，人们对基因组三维结构的认识加深。为了探索和可视化多层次三维基因组特征及其与表观基因组和基因表达的关联，建立一个整合性的多组学数据库变得尤为必要。
关键观点2: EXPRESSO数据库的特点和成果
EXPRESSO数据库整合了三维基因组数据和表观及转录组数据，提供了多种数据可视化功能。该数据库有助于揭示基因组空间结构与基因调控的关系，为研究基因组三维结构及其在人类健康和疾病中的作用提供了重要研究平台。
关键观点3: EXPRESSO数据库的应用价值
该数据库的应用将有助于理解基因调控机制、疾病发生机制以及药物研发等，对于生物医学研究和人类健康具有重要意义。
文章预览
近年来，随着染色质构象捕获技术 (3C) 及其衍生技术 (如Hi-C、HiChIP和ChIA-PET) 的发展，人们对基因组三维结构的认识不断深入。大型合作项目如ENCODE和4D Nucleome以及GEO数据库中积累了大量的三维基因组数据。因此，建立一个整合性的多组学数据库来探索和可视化多层次三维基因组特征及其与表观基因组和基因表达的关联变得尤为必要。 2024年11月6日，南方科技大学医学院 冯宇亮 课题组联合多家研究机构 开发了一个名为EXPRESSO的多组学数据库，该数据库整合了人类46种不同组织的三维基因组学数据，为研究人员提供了探索基因组空间结构与基因调控关系的重要工具 。该研究成果作为Breakthrough Article发表在 Nucleic Acids Research 期刊上：题为： EXPRESSO: a multi-omics database to explore multi-layered 3D genomic organization 。 基因组的三维结构在基因调控中起着关键作用。
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