Brief Bioinform丨杨力/董楠卿团队开发蛋白质亚细胞定位预测的新型“文生图”多模态模型-deepGPS

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蛋白质的功能行使与其亚细胞定位密切相关，因此鉴定蛋白质的亚细胞定位对于理解其在不同生理和病理条件下的功能至关重要。除了利用实验直接观测蛋白质的亚细胞定位，近年来针对蛋白质亚细胞定位预测的计算生物学工具也相继被开发出来。按照其输入和输出类型的不同，上述计算生物学工具主要可分为两类：一类是以DeepLoc为代表的基于蛋白质序列输入、生成定位文本标签 （text-to-text） 的预测模型；另一类是以Cytoself为代表的自监督蛋白质定位聚类模型，该模型利用变分自编码器对原始蛋白定位图像进行重构 （image-to-image） ，以学习蛋白质定位模式。然而，前者仅输出文本标签，难以直观展现蛋白质的定位分布，而后者虽能解析已知蛋白的定位模式，但无法预测未知蛋白的定位图像。 2025年4月12日，复旦大学生物医学研究院 杨力 研究组与 ………………………………