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空间转录组学揭示与肺纤维化中远端肺重塑相关的分子生态位失调 || Nature Genetics

MCBRLab  · 公众号  ·  · 2025-03-14 01:00
    

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    2025年02 月03日, Banovich Lab(团队详情在文末)在《Nature  Genetics》上见刊了一篇题为“ Spatial transcriptomics identifies molecular niche dysregulation associated with distal lung remodeling in pulmonary fibrosis”的研究论文,其中指出 远端肺结构和细胞组成的大规模变化是肺纤维化(PF)的一个标志,但导致疾病发生的空间背景仍不明确。 通过基于图像的空间转录组学技术,作者分析了来自35个不同肺样本的160万个细胞的基因表达情况。 通过互补的基于细胞的分析方法和创新的不依赖细胞的分析方法,作者分析了PF中出现的细胞类型的定位,确定了经典PF组织病理学特征的细胞和分子基础,并在健康和PF肺中识别出多种不同的分子定义的空间微环境。 利用机器学习和轨迹分析,在重塑严重程度梯度上对肺泡进行分割和排序,作者识别出与进行性远端肺病理相关的组成和 ………………………………

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