研究进展：MassiveFold预测程序-AlphaFold3 | Nature Computational Science

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AlphaFold是由位于伦敦的谷歌姐妹公司DeepMind开发的蛋白质预测工具，可预测的结构几乎覆盖了完整的人类蛋白质组（蛋白质组是一个生物表达的全部蛋白质） 在AlphaFold中，大规模采样获得了更多的结构多样性。结合有效的置信度排序，这开启了单体结构和最重要蛋白质组装的提升建模能力。然而，这种方法在GPU成本和数据存储方面，曾经存在困难。 近日，法国里尔大学（Université de Lille）Nessim Raouraoua，Guillaume Brysbaert等，在Nature Computational Science上发文，报道了MassiveFold，这是AlphaFold的优化和可定制版本，可以并行运行预测，将计算时间从几个月减少到几个小时。MassiveFold是可扩展的，在从单个计算机到大型GPU基础架构的任何设备上运行，可以充分受益于所有计算节点。 MassiveFold: unveiling AlphaFold’s hidden potential with optimized and parallelized massive sampling. Mas ………………………………