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视频连载05 - 这个为生信学习和生信作图打造的开源R教程真香!!!

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-07-12 21:00

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点击 阅读原文 跳转完整教案。 1 思考题 2 R基础 2.1 R安装 2.2 Rstudio基础 2.2.1 Rstudio版本 2.2.2 Rstudio安装 2.2.3 Rstudio 使用 2.3 R基本语法 2.3.1 获取帮助文档,查看命令或函数的使用方法、事例或适用范围 2.3.2 R中的变量及其初始化 2.3.3 变量类型和转换 2.3.4 R中矩阵运算 2.3.5 R中矩阵筛选合并 2.3.6 str 的应用 2.3.7 R的包管理 2.4 ggplot2绘图 2.4.1 数据格式转换和字符串处理 2.4.2 配色 2.4.3 pheatmap绘制热图 3 R plots 3.1 qplot绘制图形 (王绪宁) 3.2 热图绘制 3.2.1 生成测试数据 3.2.2 转换数据格式 3.2.3 分解绘图 3.2.4 图形存储 3.3 热图美化 3.3.1 对数转换 3.3.2 Z-score转换 3.3.3 抹去异常值 3.3.4 非线性颜色 3.3.5 调整行或列的顺序 3.4 热图绘制 - pheatmap 3.5 聚类热图如何按自己的意愿调整分支顺序? 3.5.1 数据示例 3.5.2 绘制一个聚类热图很简单 3.5.3 如何自定义分支顺序呢 3.5.4 人为指 ………………………………

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