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新算法全面评估解析的电镜蛋白结构细节是否真的靠谱【PNAS】

生物极客  · 公众号  · 生物  · 2017-07-10 14:14
    

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在看文章的时候,我们总能第一眼看到所解析的结构是几埃,几埃,这真的很重要的吗? 我们所看到的结构细节究竟有多靠谱那?   我们还可以可以提高我们结构的精度吗? 冷冻电镜(cryo-EM) - 能够在分子水平上显示病毒,蛋白质和其他生物结构。 最近,已经以分辨率高于 4 埃的方式报告了具有相关原子坐标的冷冻电镜结构。然而,很少有人严格评估观测到的特征的可靠性或实验数据与其对应的残差水平和模型之间的相关性。通常,这种相关性以被称为 FSC 的曲线来报告, FSC 是空间频率的函数。虽然包含丰富的信息,但并不保证本地特征的真实性,也不表明模型中的哪些特征与观察到的密度一致或不同意。 理想情况下,可以使用分子模型来生成在其大部分 ………………………………

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