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文献分享 |Nature Microbiology|复杂微生物组中可移动遗传元件及其细菌宿主的空间映射

杨朝勇课题组  · 公众号  ·  · 2024-07-17 23:36

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大家好!为大家介绍一篇近期发表在 Nature Microbiology 的文章,题目为 “ Spatial mapping of mobile genetic elements and their bacterial hosts in complex microbiomes ” 。本文作者将 单分子 DNA 荧光原位杂交 (FISH)和 多重核糖体 (r)RNA-FISH相结合,发展了在复杂微生物群落中空间映射细菌移动遗传元件(MGEs)并识别其细菌宿主的方法, 揭示了细菌群落结构与 MGEs 空间分布之间的相关性。文章的通讯作者是来自美国康奈尔大学的Iwijn De Vlaminnck副教授。 ‍‍‍ 01 背景介绍       移动遗传元件 (MGEs ) 在细菌群体中的传播促进了功能性状的传递,包括抗菌耐药性 ( AMR ) 和毒力等。尽管MGEs在微生物生态学研究中处于中心地位,但目前仍然缺乏研究MGE在自然群落中的空间传播机制和 MGEs- 宿主关系 的有效方法。 ‍ 02 ‍ 设计思路 作者使用携带有编码 GFP 基因的 pJKR-H-tetR 质粒的大肠杆 ………………………………

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