Nat. Commun. | RNAmigos2打造RNA结构筛选加速器

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DRUG AI RNA 是一类尚未被充分开发的潜在药物靶点。传统的结构基础虚拟筛选（VS）依赖对结合位点的模拟对接，但在大规模分子库和RNA靶点中扩展性有限。为克服这一挑战，研究人员提出了一套面向RNA的结构驱动虚拟筛选流程，结合粗粒度三维建模、合成数据增强和RNA特有的自监督学习。该模型相较分子对接提速达一万倍，并在结构异构测试集中将活性化合物准确排入前2.8%。此外，该方法对结合位点变化具有鲁棒性，并在2万个化合物的体外筛选中成功识别出RNA核开关靶点，1%命中率下的平均富集因子为2.93。这是首个经实验证实、基于深度学习的RNA结构虚拟筛选成功案例。 绝大多数RNA并不编码蛋白，而非编码RNA（ncRNA）在多种生物过程中发挥重要作用。尽管RNA在体内广泛存在，但首个RNA靶向药物直到近期才获得批准，目前市面上绝大多数小分子疗法 ………………………………