最近大火的ATAC, 究竟是干什么的

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欢迎关注”生信修炼手册”! ATAC全称如下 Assay for Transposase Accessible Chromatin with hight-throughput sequencing 名字很长，翻译为转座酶可及的染色质区域的高通量测序。在这个冗长的名字中，高通量测序我们一点都不陌生，NGS二代测序已经发展了这么多年，各种组学技术，比如WES, WGS, RNA_seq等等，应用非常广泛。那么”转座酶可及的染色质区域”又是什么呢？这个词应该这样来理解，通过转录酶获取到的染色质可及区域。 转座酶是由转座子编码的一种酶，在NGS中用于文库构建，最常用的是Tn5转座酶，其随机性好，稳定性高，插入位点易测。通过转座酶， 只需一步反应就可以实现DNA的片段化，末端修复，接头连接，大大加快了文库构建的过程，illumina的Nextear系列试剂盒就是利用 ………………………………