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超详细视频讲解 | 互作网络分析之奥妙全揭秘,不看你就亏大啦!

代谢组metabolome  · 公众号  ·  · 2024-11-03 08:00
    

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点击蓝字“代谢组metabolome”,轻松关注不迷路 生科云网址: https://www.bioincloud.tech/ 对于环境样本中的微生物群体来说,往往存在相互拮抗或协同的关系,这些关系可以描述为一个网络,不同微生物或基因间存在着不同的网络关系。 那这种网络关系如何被建立又如何被挖掘呢? 让我们一起来看下面的介绍吧!     网络分析 是通过计算feature的相关系数(Spearman、Pearson和Kendall),并将显著相关的 feature节点相连 ,绘制成 网络图 。其中,圆圈代表一个feature,大小代表其相对丰度,不同的颜色代表不同的feature,圆圈之间的线条代表这两个feature间的 相关性显著 ( p 值小于0.05),线条颜色 红 色代表 正相关 , 蓝 色代表 负 相关,线条越 粗 ,相关系数绝对值越 大 。通过网络图的分析,可以推断feature之间的 相关性 ,对一些与 疾病相关的微生物研究 ………………………………

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