专栏名称: 生信修炼手册
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《零基础免费学扩增子分析》视频课(含ppt及相应代码),无需转发,直接获取

生信修炼手册  · 公众号  ·  · 2022-06-13 20:28
    

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扩增子测序是一种二代靶向测序技术,它使用PCR技术来生成称为扩增子的DNA序列。它简单、快速、应用广泛。扩增子测序可以有效地识别微生物高可变区并有效获取微生物物种的信息。 扩增子测序包括16S rDNA, 18S rDNA以及ITS的测序。16S rDNA是细菌分类学研究中最常用分类的marker基因信息,其序列包含9个可变区(Variable region)和10个保守区(constant region)。可变区因细菌而异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关。通过检测16S rDNA的序列变异和丰度,可以了解环境样品中群落多样性信息。基于16S rDNA的分析在微生物分类鉴定、微生态研究等方面起到重要作用。 针对扩增子测序的统计分析流程,微科盟 制作了8节免费系列课程对扩增子分析进行系统的介绍 , 助力您的微生物生态研究,本次8节课程涵盖了8个内容,列表 如下。 1. 用R语言进行菌 ………………………………

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