肺腺癌单细胞数据集GSE189357复现(一)：数据下载整理、降维聚类与分群

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分享是一种态度 前言 Hello小伙伴们大家好，我是生信技能树的小学徒”我才不吃蛋黄“。继胃癌单细胞复现系列完结之后，经过了短暂的休整，我又回来了。之前每一期的推文，我都有认真准备。推文发出之后，也仔细阅读了每一条留言。非常感谢大家的鼓励。 接下来的一段时间里，我将再次开启一个新的学徒分享系列，给大家系统整理肺腺癌单细胞测序的代码。 文章的具体内容，二由老师已在生信菜鸟团公众号发布，请大家移步阅读： 单细胞测序+空间转录组描绘从癌前病变到浸润性肺腺癌的动态演变 。 本系列包括但不限于以下内容：数据下载与读取；质控和去批次；降维聚类；分群注释；差异分析；富集分析；亚群细分；inferCNV;拟时序分析；细胞通讯；SCENIC转录因子分析等。 为了加深对代码的理解，除了阅读推文，可以加入单细胞月更群 ………………………………