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我们预测人类基因组中任意遗传变异的表型后果的能力仍然较差。这一问题体现在“可干预”基因中发现的大量意义未明变异(VUS)上,所谓“可干预”基因是指通过确定致病性变异能够改变临床管理的基因。例如,破坏BRCA1基因的种系杂合变异显著增加了早发乳腺癌和卵巢癌的风险,这些变异是可干预的,因为更频繁的筛查或预防性手术可以改善预后。临床测序可以识别特定变异作为风险标志。然而,截至2018年1月,大多数BRCA1单核苷酸变异(SNVs)被归类为VUS。VUS通常表现为罕见的错义SNV,但也包括可能影响信使RNA(mRNA)水平的变异。进一步说明与VUS相关的挑战的是,存在数百个BRCA1 SNV的解释存在相互冲突的情况。 解决意义未明变异(VUS)有两种主要方法。第一种方法是数据共享,依赖于这样的假设:随着更多个体对BRCA1基因进行测序,反复观
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