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Genome Biol丨资治科、李立开发人机交互框架提升染色质拓扑相关结构域识别能力,助力三维基因组研究

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2024-12-23 08:49
    

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在哺乳动物细胞核中,染色体通过复杂的折叠形成三维基因组结构,而拓扑相关结构域 (TADs) 是其关键特征之一,这些结构在细胞发育与疾病发生中发挥着重要作用。然而,如何精准检测TAD仍然是一个亟待解决的挑战。尽管已经提出多种检测方法,但由于背景噪声及TAD结构的复杂嵌套关系,准确识别这些结构单元仍然面临困难。 近日,中国科学院深圳先进技术研究院 资治科 研究员团队联合华中农业大学 李立 教授团队,在 Genome Biology  杂志在线发表了题为 HTAD: a human-in-the-loop framework for supervised chromatin domain detection  的研究成果, 研究人员开发了一种基于“人机交互”框架的TAD识别方法,命名为HTAD 。 该方法提出了“人机交互” (HITL) 的创新思路,通过结合主动学习和人工的判断力,显著提升了机器学习模型的性能。研究团队深入分析了现有 ………………………………

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