复旦团队单细胞测序上分 Cell，高手都怎么设计实验和分析数据的？

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Cell  重磅！今年 3 月复旦大学团队在  Cell  发表研究成果，团队利用 单细胞测序技术 对 143 名患者的 225 个癌症样本进行转录组分析，阐明肿瘤内浸润免疫细胞的异质性，进而鉴定出一群 HLA-DR+CD74+ 中性粒细胞亚群。通过单细胞代谢通路分析、小规模代谢物体外筛选等揭示了基于中性粒细胞的治疗潜力，也为癌症联合疗法的开发提供理论基础 [1] 。 单细胞测序研究能够 描绘组织内细胞图谱及异质性、发掘样本中的少数/稀有细胞群体、鉴定同一细胞类型的不同状态和功能亚型 ，对机制探究、关键分子的确定和疾病的诊疗具有重要意义。 那 如何根据实验需求和表型，正确设计单细胞实验 （如分组设置、样本制备流程及注意事项、测序方案等）？ 数据分析流程及分析思路有哪些 （如细胞亚群的注释、差异基因分析、细胞发育/分化轨迹、细胞间互作 ………………………………