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SBS合成测序的读长记录?

我是建设者  · 公众号  ·  · 2024-12-01 21:19
    

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合成测序 SBS 被广义地认定为短读长测序,这区别于对天然 DNA 分子不间断读取所获取的长读长。 SBS ,特别是以可逆终止子为核心的测序手段,成为 Illumina 或者说高通量测序(也就是所谓的二代测序)的 代名词 。 可逆终止子 带有聚合的阻断基团和可断裂荧光基团标记,通过掺入这样的可逆终止子来提示被测序的碱基信息,通过去除阻断基团来进行循环。 Element 和 PacBio Onso 的创新 将可逆终止与通过荧光探测碱基信息的步骤分开 ,部分消除了簇内分子反应不同步所带来的读取错误率。 可逆终止的 SBS 反应由于受到聚合酶效率的影响,因而更多产生 150bp 左右的读长。因此在 Illumina 主导 NGS 的这么多年中,受其读取准确率和读长的限制,我们习惯了 30x 人类基因组的标准(人类基因组的大小大约为 3.2 亿碱基对 /3.2 Gb )。 当然 Illumina 在这么多年的发 ………………………………

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