今天看啥  ›  专栏  ›  智药邦

PDBbind 2021版完全体诞生:蛋白-配体复合物精选集已上线

智药邦  · 公众号  ·  · 2024-09-10 09:00
    

文章预览

近日, PDBbind 2021 版蛋白 - 配体复合物精选集已在 PDBbind+ 网络平台( http://www.pdbbind-plus.org.cn/ )上公布。 在药物设计领域中广受欢迎的 PDBbind 数据集提供一个很有价值的选项,即蛋白 - 配体复合物精选集( refined set )。 该数据集通过检查 PDBbind 中收录的所有蛋白 - 配体复合物,去除存在各种三维结构中的问题、亲合性数据的问题或其他问题的复合物,从而筛选出各方面质量较高的复合物作为“精选集”。 事实上,只有约四分之一的蛋白 - 配体复合物被纳入精选集,体现了该数据集的高标准质量。 精选集为分子对接、亲合性打分预测等研究等提供了更坚实的数据基础,被众多国内外研究者采用。 PDBbind数据库从2021版开始提供两种精选集:①“标准精选集”,当前包含5142个复合物;②“拓展精选集”,包含相同的5142个复合物以及1221个额外的复合 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览