专栏名称: 生信分析手册
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4+缺氧相关+WGCNA+机器学习,干湿结合发文不要太简单,不要纠结没思路,学起来就是了!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-06-27 18:00

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Identification of hypoxia- and immune-related biomarkers in patients with ischemic stroke”,这篇文章发表在 Heliyon 期刊上,影响因子为4。 结果: DEGs筛选 为了探索IS和正常状态之间基因表达差异的程度,作者挖掘了差异表达基因(DEGs)。总共筛选出4171个IS组和对照组之间的DEGs,其中包括1645个上调基因和2526个下调基因(图1A)。热图显示了前15个上调和下调的DEGs(图1B)。在200个缺氧相关基因和4171个DEGs的交集中,获得了45个DEHRGs,用于后续分析(图1C)。 免疫浸润细胞分析 由于一项现有研究专注于调查胶质细胞介导的免疫反应在IS发病机制中的作用,作者首先通过免疫浸润分析探索了AD和正常样本之间的免疫细胞浸润差异。为了获得IS和对照样本之间的差异性免疫细胞,作者将28种免疫浸润细胞的富集比例绘制成热图,如图2A ………………………………

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