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昼夜节律与疾病的关系,多分组,多节点,时间序列分析的标准生信范文

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-08-30 07:00

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不设置🌟有时会收不到公众号内容,code一段时间后会失效 时间序列分析,昼夜节律基因 问题1:人源化小鼠肝脏(也就是小鼠肝脏打了人的肝细胞)的转录组上游比对谁的参看基因组呢,人的还是鼠的,同理,小鼠种了人源的肿瘤的话也是这么干。 答案:认为组装的人和鼠都有的参考基因组 问题2:时间序列,多条件分组有哪些好用的包? 总结3:这篇文章给了很多人鼠数据联合分析,联合比较大示例,一定要把他们串起来,相互验证 就是这个处理时间,节律,多分组,非常方便。 #Running an example library( "dryR" ) # prepare arguments countData = simData[[ "countData" ]] group = simData[[ "group" ]] time = simData[[ "time" ]] # prefilter keep 0 countData # run the analysis for count data (e.g. RNA-Seq data) dryList = dryseq(countData,group,time) # explore the results dryList[[ "results" ]] # data frame summarizin ………………………………

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