《Nature cell biology》：TGFβ和Hippo共同驱动肠道再生

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昨天，西奈山医院 Jeffrey L. Wrana 通讯在《 Nature cell biology 》发表论文“ Chromatin remodelling in damaged intestinal crypts orchestrates redundant TGFβ and Hippo signalling to drive regeneration ”。 作者对辐照和未受损小肠隐窝的细胞核进行了转录组（ RNA 测序）和基因组可及性（转座酶可及染色质测序）的多组学分析。整合分析揭示了聚类中的预期细胞类型。仅转录组分析与基因表达驱动聚类一致。分化细胞沿着不同谱系分裂的 ATAC 聚类较少。肠道干细胞和再生干细胞形成了独特的聚类。细胞类型相关峰的基序分析显示了预期的富集。一些峰是分泌细胞特有的，再生干细胞与肠道干细胞和分化细胞有重叠的可及性，可能反映了动态的细胞状态转变。 作者整合了再生干细胞、肠道干细胞和肠上皮细胞的转录组，推断了拟时间轨迹，并创建了离散的区间。 Lgr5 阳性肠道干细胞 ………………………………