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学习笔记总结于『生信技能树』马拉松课程 本文学习复现《Oxidative Stress Response Biomarkers of Ovarian Cancer Based on Single-Cell and Bulk RNA Sequencing》（基于单细胞和Bulk转录组的卵巢癌氧化应激反应生物标志物）一文中的图，其中Oxidative Stress Response缩写为ROS。文章包含了芯片、转录组、单细胞等技术，适合用来复现及学习 三、AUCell 1.基因 rm(list = ls()) load( "../1.ros/rosgene.Rdata" ) load( "../2.single_cell/markers.Rdata" ) 图32 图33所示，文章打算用 DotPlot() 函数来可视化“每个细胞亚组中与特定OS反应相关的标记基因”，而这个标记基因的标准是：单细胞亚群的marker基因其avg_log2FC大于3的，与ros相关基因，两者取交集，即标记基因 图33 table(abs(allmarkers $avg_log2FC )>3) # 但是单细胞亚群的marker基因其avg_log2FC大于3的 # [1] FALSE TRUE # [2] 22536 1 可能由于之前的复现
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